Über die Beauftragung als Direktor hat am 16.12.2005 das Akademie-Kuratorium als Besetzungsgremium durch Wahl entschieden, nachdem der Evangelische Oberkirchenrat in Stuttgart sowie der Landeskirchenausschuss sich für Joachim L. Beck ausgesprochen hatten. Mit der Ernennung Becks wurde zugleich die Leitungsstruktur der Evangelischen Akademie Bad Boll geändert: Statt bislang zwei Direktoren wird es künftig nur noch einen Direktor geben, an dessen Seite außerdem ein Geschäftsführer tätig ist. Joachim L. Beck ist mit den Bad Boller Verhältnissen bestens vertraut. Als Studienleiter für den Bereich Medizinethik und Gesundheitspolitik war er im März 1994 an die Akademie gekommen. Im Februar 2004 ist er in die Direktion aufgerückt. Vor seinem Akademie-Engagement war Joachim L. Beck auf Pfarrstellen in Sindelfingen, Esslingen und Uhingen tätig.
Erleichtert ist der Vorsitzende des Akademie-Kuratoriums Martin Bauch, dass alle beteiligten Gremien in enger Abstimmung die Wahl von Joachim L. Beck möglich gemacht haben. Um eine weitere Reduktion an der Spitze der Akademie ausreichend zu bedenken, seien im Kuratorium Sonderberatungen erforderlich gewesen. Bauch sagte, das Kuratorium halte Joachim L. Beck "für einen ausgezeichneten Geschäftsführenden Direktor, der durch seine offene Zusammenarbeit besticht" und der mit dem Geschäftsführer Achim Ganßloser schon nach kurzer Zeit ein gutes Team gebildet habe.